Arktická univerzita Norska
Výzkumné centrum ArcEcoGEN při Tromsø Museum, Arktické univerzitě Norska (UiT), je hostitelskou institucí projektu MEMELAND. V Tromsø Prof Tony Brown a jeho tým projekt koordinují a specializují se na extrakci a analýzu starobylé DNA ze sedimentů (sedaDNA). Ve spolupráci se štrasburským týmem provozuje Tromsø terénní odběrový tým, který bude vrtat jezerní i některé mokřadní lokality v severních a západních částech studované oblasti včetně celé Skandinávie, střední Evropy, severního Německa a Francie. Projekt navíc využívá materiál z mnoha dalších institucí vhodný pro analýzu sedaDNA. Celkově bude zpracováno více než 100 jader a 4000-8000 vzorků, které pomohou popsat proměny evropské biodiverzity za posledních 2000 let, tedy od římského období. To bude umožněno vysoce přesným datováním (viz sekce Salzburg) a doplněno fekálními i dalšími biomarkery (tým Eawag) a archeobotanickými studiemi (tým Oxford).
Skupina v Tromsø je specialistou na extrakci a analýzu sedaDNA z různých paleoekologických kontextů, především z jezer, ale i z mokřadů, niv, svahových sedimentů a archeologických lokalit. Tato studie se zaměřuje na malá jezera v zemědělské krajině severozápadní Evropy. Využíváme především dvě metodiky: zaprvé amplikonovou neboli metabarcoding analýzu, při níž je DNA ve vzorku cíleně vybrána a amplifikována před sekvenováním. Jde o hlavní metodiku projektu, protože se ukázala jako nejspolehlivější a nejefektivnější vzhledem k nákladům. Obvykle je však omezena na určité skupiny organismů včetně cévnatých rostlin a obratlovců, i když lze amplifikovat i jinou DNA. Současně ji nelze vnitřně autentifikovat podle poškození DNA a obtížněji se dostává pod druhovou úroveň. Tato omezení je možné překonat neamplikonovým neboli shotgun sekvenováním. Tromsø tým neustále vyvíjí nové metody, aby zlepšil hloubku informací získaných z těchto sedimentárních prostředí a lépe porozuměl omezením i zkreslení dat.
V mnoha případech budou tato data kombinována s biomarkery a archeobotanickými daty včetně pylu, aby vznikla komplexnější rekonstrukce minulých zemědělských ekosystémů. To zahrnuje nejen plodiny a domestikovaná zvířata, ale také plevele, synantropní druhy (parazité, škůdci, komenzálové apod.) a proměny nížinných ekosystémů severozápadní Evropy. Data umožní vytvořit nový příběh evropské biodiverzity na dvou úrovních: příběhy jednotlivých lokalit a druhů i regionální struktury na úrovni biomů definující biodiverzitu severozápadní Evropy. Jde o důležité důkazy pro snahu udržet vysokou biodiverzitu a kvalitu životního prostředí tváří v tvář klimatické změně i rostoucímu tlaku populace a technologického rozvoje. Zajímavé je, že podobná situace zde už byla; dějiny zemědělství od římské přítomnosti v severní Evropě jsou historií trvalého růstu populace a prosperity, avšak se složitými dopady na biodiverzitu a přírodu. Tuto archeologickou a historickou dimenzi rozvíjí tým Oxford. Výsledky budou publikovány na různých prostorových úrovních a budou sloužit k pochopení proměn krajiny a ekologie v celé oblasti, včetně prostorového modelování realizovaného ve spolupráci s Laboratoří kvantitativní ekologie na Univerzitě Karlově v Praze.